O programa de Mestrado poderá dispor dos laboratórios de Física, Química, Biologia, Engenharia de Produção (LEP), Logística e Geoprocessamento (NILO), Hidrocarbonetos (LABOHI), Qualidade Ambiental, Informática (LABINF), Madeira, Propriedade dos Materiais, Laboratório Multiusuário de Engenharia Florestal, Herbário Prof.ª Dra. Marlene Freitas da Silva (MFS) e da Coleção Zoológica Didático-Científica da UEPA.

1. Laboratório de Física: é climatizado em 20 m², com materiais e equipamentos adequados para a realização de experimentos em Física nas áreas de mecânica, mecânica dos fluidos, eletromagnetismo, termodinâmica e ótica geométrica.

2. Laboratório de Química: é climatizado em 30 m², com equipamentos, mobiliário e vidrarias específicas, além de um estoque de reagentes e demais materiais utilizados nas atividades deste ambiente.

3. Laboratório de Engenharia de Produção (LEP): é climatizado em 60 m², desenvolvendo atividades nas áreas de gestão da qualidade, gestão econômica e gestão do conhecimento. É equipado com 15 computadores, além de um conjunto de software.

4. Laboratório de Logística e Geoprocessamento: é climatizado em 60 m², desenvolvendo pesquisas na tomada de decisões estratégicas e gestão da sustentabilidade ambiental. É equipado com 12 computadores e softwares apropriados para o geoprocessamento aliado ao Sistema de Informações Geográficas (SIG).

5. Laboratório de Hidrocarbonetos (LABOHI): é climatizado em 1230 m², desenvolvendo pesquisas de monitoramento de impactos ambientais, causados por diferentes contaminantes, como análises químicas de hidrocarbonetos e metais pesados. O laboratório conta com equipamentos de última geração como: Espectrofotômetro UV-VIS; Espectrofotômetro de Emissão Atômica.

6. Laboratório de Informática (LABINF): funciona com estações de trabalho para processamento digital de imagens de satélites, mapas digitais, modelos digitais de terreno, sistema de informação geográfica e para a utilização de programas gráficos. Para isso, dispõe de 15 computadores de última geração dotados de monitores de alta resolução e conjunto de softwares.

7. Herbário Prof.ª Dra. Marlene Freitas da Silva (MFS): é climatizado em 50m², com um acervo de 5.500 amostras de plantas que estão registradas em um banco de dados (software BRAHMS) e está indexado no Index Herbariorum (IH). O MFS conta com o apoio do Museu Paraense Emílio Goeldi (MPEG) e da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA – Amazônia Oriental).

8. Coleção Zoológica Didático-Científica da Universidade do Estado do Pará (CZDC-UEPA): conta com um acervo de cerca de 1000 espécimes de animais invertebrados e de vertebrados que estão informatizados em banco de dados. A CZDC se encontra em uma sala de 30m² contendo equipamentos e mobiliário compatível com sua função curatorial.

9. Laboratório Multiusuário de Engenharia Florestal (LAMEF):  possui 40 m² com capacidade para receber turmas com até 15 alunos/aula. O LAMEF desenvolve pesquisas em ciência e tecnologia de recursos naturais com ênfase em anatomia e identificação de madeiras, propriedades físicas, mecânicas e secagem da madeira, avaliação energética de matéria-prima, resíduos, avaliação da qualidade de produtos madeireiros e não madeireiros, morfologia e anatomia vegetal, botânica e sistemática vegetal e entomologia florestal.